Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Trappc2lQ9JME7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Trappc2lQ9JME7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms