Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Col5a3Q9JLI2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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