Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmbr1Q9JIT0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms