Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Pgpep1Q9ESW8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Pgpep1Q9ESW8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms