Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SelenofQ9ERR7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SelenofQ9ERR7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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