Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clstn2Q9ER65 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clstn2Q9ER65 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms