Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms