Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr1Q9EPQ1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr1Q9EPQ1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr1Q9EPQ1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr1Q9EPQ1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr1Q9EPQ1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tlr1Q9EPQ1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr1Q9EPQ1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms