Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Clstn1Q9EPL2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clstn1Q9EPL2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms