Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SrpraQ9DBG7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms