Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smg9Q9DB90 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smg9Q9DB90 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smg9Q9DB90 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smg9Q9DB90 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Smg9Q9DB90 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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