Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmem239Q9DA47 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmem239Q9DA47 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms