Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgf29Q9DA08 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms