Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifi35Q9D8C4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifi35Q9D8C4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms