Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tube1Q9D6T1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tube1Q9D6T1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms