Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ca13Q9D6N1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ca13Q9D6N1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ca13Q9D6N1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms