Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tubb4aQ9D6F9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms