Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rufy3Q9D394 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms