Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Obox1Q9D350 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Obox1Q9D350 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Obox1Q9D350 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Obox1Q9D350 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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