Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms