Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snapc3Q9D2C9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Snapc3Q9D2C9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms