Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Trappc6bQ9D289 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trappc6bQ9D289 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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