Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms