Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rfc5Q9D0F6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rfc5Q9D0F6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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