Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc47Q9D024 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc47Q9D024 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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