Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Shmt2Q9CZN7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms