Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc77Q9CZH8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc77Q9CZH8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ccdc77Q9CZH8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc77Q9CZH8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccdc77Q9CZH8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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