Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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