Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gins3Q9CY94 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gins3Q9CY94 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms