Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ChtopQ9CY57 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms