Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Sgo1Q9CXH7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Sgo1Q9CXH7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sgo1Q9CXH7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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