Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Khdc3Q9CWU5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms