Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWS1

Rnf135, E3 ubiquitin-protein ligase RNF135, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf135Q9CWS1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf135Q9CWS1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf135Q9CWS1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf135Q9CWS1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf135Q9CWS1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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