Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot11Q9CWN7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms