Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BccipQ9CWI3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms