Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MINDY3Q9CV28 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MINDY3Q9CV28 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms