Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sppl3Q9CUS9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms