Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhobtb3Q9CTN4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms