Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rprd1bQ9CSU0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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