Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9CRC3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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