Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rwdd1Q9CQK7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rwdd1Q9CQK7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rwdd1Q9CQK7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rwdd1Q9CQK7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rwdd1Q9CQK7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rwdd1Q9CQK7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rwdd1Q9CQK7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms