Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufb9Q9CQJ8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms