Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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