Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
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Atp6v0e1Q9CQD8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
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