Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Rnaseh2cQ9CQ18 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms