Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Chmp3Q9CQ10 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp3Q9CQ10 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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