Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms