Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Trim11Q99PQ2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Trim11Q99PQ2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Trim11Q99PQ2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim11Q99PQ2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Trim11Q99PQ2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim11Q99PQ2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim11Q99PQ2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim11Q99PQ2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms