Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf2a1Q99PM3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms