Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NsmfQ99NF2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms